Diadema ascensionis (Echinodermata: Echinoidea) is not restricted to Oceanic Islands: evidence from morphological data.

The genus Diadema presently consists of seven species, two of which are known from the Brazilian coast: D. antillarum and D. ascensionis. The first is usually known for shallow coastal areas, while the second was apparently restricted to oceanic islands. In February 2011, a dense population of D. ascensionis was observed on the coastal reefs of Praia do Francês (Alagoas State, northeastern Brazil). Five specimens were collected and transported to the laboratory where morphological studies of the test and pedicellariae were conducted. Subsequently, visits were made to scientific collections in order to compare and confirm species identifications. Our observations confirm the presence of tridentate pedicellariae with narrow and strongly curved valves. The axial cavity in the tips of the spines is filled with dense nonreticular tissue. This taxonomic data confirms the occurrence of D. ascensionis in coastal areas. On the coastal reefs of Praia do Francês, animals were observed from the beach to the reef formations about 200 m offshore in areas with a sandy substrate and in reef cavities, usually in clear and well illuminated waters. Solitary individuals or groups of up to 15 individuals formed dense populations in the area. We stress the importance of pedicellariae for the specific identification of the Diadematidae, considering that they are quite constant and reliable at this taxonomic level. Our results demonstrate that D. ascensionis is not restricted to insular environments and that this species may be common in shallow coastal habitats.

Diadema ascensionisMortensen, 1909 (Echinodermata: Echinoidea) is not restricted to Oceanic Islands: evidence from morphological data / Diadema ascensionisMortensen, 1909 (Echinodermata: Echinoidea) não está restrito a Ilhas Oceânicas: evidências de dados morfológicos

The genus Diadema presently consists of seven species, two of which are known from the Brazilian coast: D. antillarum and D. ascensionis. The first is usually known for shallow coastal areas, while the second was apparently restricted to oceanic islands. In February 2011, a dense population of D. ascensionis was observed on the coastal reefs of Praia do Francês (Alagoas State, northeastern Brazil). Five specimens were collected and transported to the laboratory where morphological studies of the test and pedicellariae were conducted. Subsequently, visits were made to scientific collections in order to compare and confirm species identifications. Our observations confirm the presence of tridentate pedicellariae with narrow and strongly curved valves. The axial cavity in the tips of the spines is filled with dense nonreticular tissue. This taxonomic data confirms the occurrence of D. ascensionis in coastal areas. On the coastal reefs of Praia do Francês, animals were observed from the beach to the reef formations about 200 m offshore in areas with a sandy substrate and in reef cavities, usually in clear and well illuminated waters. Solitary individuals or groups of up to 15 individuals formed dense populations in the area. We stress the importance of pedicellariae for the specific identification of the Diadematidae, considering that they are quite constant and reliable at this taxonomic level. Our results demonstrate that D. ascensionis is not restricted to insular environments and that this species may be common in shallow coastal habitats.

O gênero Diadema é composto por sete espécies, das quais duas são conhecidas para o litoral brasileiro: D. antillarum e D. ascensionis. A primeira é principalmente conhecida em áreas costeiras, enquanto que a segunda está aparentemente restrita a ilhas oceânicas. Em fevereiro de 2011, uma densa população de D. ascensionis foi observada nos recifes costeiros da Praia do Francês, no Estado de Alagoas, Região Nordeste do Brasil. Cinco espécimes foram coletados e transportados ao laboratório, onde estudos morfológicos da carapaça e das pedicelárias foram desenvolvidos. Subsequentemente, foram realizadas visitas a coleções científicas para a comparação e a confirmação da espécie. As observações, neste trabalho, evidenciaram a presença de uma pedicelária tridentada com valvas estreitas e fortemente curvadas. A cavidade axial nas pontas dos espinhos é preenchida por um denso tecido não reticular. Estes dados taxonômicos confirmam a ocorrência de D. ascensionis em áreas costeiras. Nos recifes costeiros da Praia do Francês, os animais foram observados a partir da praia em direção às formações recifais localizadas a 200 m da praia, em áreas de substrato arenoso, e nas cavidades do recife, geralmente em águas claras e bem iluminadas. Os indivíduos estavam solitários ou formando grupos de até 15 indivíduos. Destaca-se a importância das pedicelárias na sistemática dos Diadematidae, tendo em vista que as mesmas são bastante constantes e confiáveis para a identificação em nível específico. Os resultados do presente trabalho demonstram que D. ascensionis não está restrita a ambientes insulares e que esta espécie pode ser comum em habitats costeiros rasos.

First record of Cephalobaena tetrapoda (Pentastomida: Cephalobaenidae) as a parasite on Liophis lineatus (Ophidia: Colubridae) in Northeast Brazil.

Cephalobaenidae constitutes one of the main pentastomid groups infecting the respiratory tract of snakes. Six specimens of Liophis lineatus, a colubrid, were collected by active capture and pitfalls installed on the banks of the Batateiras river, close to its source, in the APA - Area de Proteção Ambiental (a protected environmental area of the IBAMA - Brazilian Institute for the Environment and Natural Resources), and in a remnant of the humid tropical forest FLONA - Floresta Nacional do Araripe, both in the municipality of Crato, state of Ceará, Northeast Brazil. Out of the six specimens of L. lineatus examined, only one had its lung infected by the pentastomid Cephalobaena tetrapoda. This represents the first record of C. tetrapoda as a parasite of a snake in Northeast Brazil, as well as the first record of a colubrid, L. lineatus, as a new host for the pentastomid in Brazil.

First record of Cephalobaena tetrapoda (Pentastomida: Cephalobaenidae) as a parasite on Liophis lineatus (Ophidia: Colubridae) in Northeast Brazil

Os Cephalobaenidae constituem um dos principais grupos de pentastomídeos que parasitam o trato respiratório de serpentes. Foram coletados seis espécimes de Liophis lineatus pela utilização de coleta ativa e pitfalls instalados às margens da nascente do rio Batateiras, próximo à nascente, ‘APA – Área de Proteção Ambiental’ (um ambiente protegido pelo ‘IBAMA – Instituto Brasileiro do Meio Ambiente e dos Recursos Renováveis’), e em um remanescente de floresta úmida, "FLONA – Floresta Nacional do Araripe". Os dois pontos de coleta estão localizados no município de Crato, Estado do Ceará. Dos seis espécimes de L. lineatus examinados apenas um estava infectado por Cephalobaena tetrapoda em seu pulmão. Isso representa o primeiro registro de C. tetrapoda parasitando uma cobra no Nordeste brasileiro, assim como é o primeiro registro de um colubridae servindo de hospedeiro para C. tetrapoda no Brasil.

A molecular method for a qualitative analysis of potentially coding sequences of DNA.

Total sequence phylogenies have low information content. Ordinary misconceptions are that character quality can be ignored and that relying on computer algorithms is enough. Despite widespread preference for a posteriori methods of character evaluation, a priori methods are necessary to produce transformation series that are independent of tree topologies. We propose a stepwise qualitative method for analyzing protein sequences. Informative codons are selected, alternative amino acid transformation series are analyzed, and most parsimonious transformations are hypothesized. We conduct four phylogenetic analyses of philodryanine snakes. The tree based on all nucleotides produces least resolution. Trees based on the exclusion of third positions, on an asymmetric step matrix, and on our protocol, produce similar results. Our method eliminates noise by hypothesizing explicit transformation series for each informative protein-coding amino acid. This approaches qualitative methods for morphological data, in which only characters successfully interpreted in a phylogenetic context are used in cladistic analyses. The method allows utilizing character information contained in the original sequence alignment and, therefore, has higher resolution in inferring a phylogenetic tree than some traditional methods (such as distance methods).

A molecular method for a qualitative analysis of potentially coding sequences of DNA

Filogenias baseadas em seqüências totais têm baixo conteúdo informativo. Erros comuns são acreditar que a qualidade dos caracteres pode ser ignorada e que é suficiente confiar nos algoritmos computacionais. Apesar de ampla preferência por métodos a posteriori para a avaliação de caracteres, métodos a priori tornam-se necessários para produzir séries de transformação independentes das topologias das árvores. Propomos um método qualitativo passo a passo para analisar seqüências de proteínas. Codons informativos são selecionados, séries de transformação alternativas de aminoácidos são analisadas e as transformações mais parcimoniosas são hipotetizadas. Conduzimos quatro análises filogenéticas em cobras Phylodrininae. A árvore baseada em todos os nucleotídeos produz a menor resolução. Arvores baseadas na exclusão das terceiras posições, numa matriz de passos assimétrica, e em nosso protocolo de análise produzem resultados similares. Nosso método elimina ruído ao hipotetizar séries de transformação explícitas para cada aminoácido informativo para a codificação de proteínas. Essa abordagem se aproxima de métodos qualitativos para dados morfológicos, nos quais apenas caracteres interpretados com sucesso num contexto filogenético são usados em análises cladísticas. O método permite utilizar informação de caracteres contidos no alinhamento original da seqüência e, portanto, tem maior poder de resolução para inferir árvores filogenéticas que alguns métodos tradicionais (como métodos de distância).

A cladistic approach to relationships in pentastomida.

The positioning of the Pentastomida among the Metazoa has provoked many debates up to the present. On the other hand, the internal relationships among the pentastomid subgroups have received much less attention in the past. We provide the first phylogenetic analyses under Hennigian principles. Thirty-two morphological characters were selected from the primary literature, analyzed manually, and then with the program Hennig86. Four most parsimonious trees were obtained; these were analyzed by successive weighting and reduced to 1 consensus cladogram 380 steps long, with a consistency index of 0.98 and a retention index of 0.99. Characters were also analyzed as unordered, producing results that were congruent with the previous analyses. The internal groups were ordered according to the following system: (Heymnonsicambria + Haffnericambria + Backlericambria (Cephalobaenida (Railietiellida nov. (Reighardiida nov. (Porocephalida (Linguatuloidea (Linguatulidae + Subtriquetridae) + Porocephaloidea (Sebekidae + Porocephalidae))))))). This phylogenetic system is largely congruent with the first modern taxonomic arrangement proposed for the Pentastomida.